São objectivos da Universidade Púnguė, além dos preconizados na Lei do Sistema Nacional de Educação e na Lei do Ensino Superior, os seguintes:

1. Formar profissionais de nível superior com alto grau de qualificação técnica e científica;
2. Realizar investigação que promova o desenvolvimento socioeconómico e o bem-estar da sociedade;
3. Disseminar o conhecimento e participar em eventos científicos, de forma a promover criatividade e soluções inovadoras;
4. Valorizar a cidadania moçambicana e a unidade nacional;
5. Permitir a transferência, intercâmbio e valorização de conhecimentos científicos e tecnológicos através de desenvolvimento de actividades de extensão;
6. Incutir na comunidade académica o alto sentido ético, deontológico e estético;
7. Promover o intercâmbio cultural, científico e técnico com instituições nacionais e estrangeiras, através das mobilidades de estudantes, corpo técnico administrativo, docentes e investigadores;
8. Promover o espírito para a mobilidade académica na produção científica e fora do território nacional;
9. Contribuir para o desenvolvimento comunitário;
10. Incentivar a criação científica;
11. Promover a liberdade de expressão;
12. Promover valores de igualdade e equidade.